微生物NMT标准化方案
微生物NMT标准化方案
一、视频资源
二、参考文献
Hexavalent chromium induced oxidative stress and apoptosis in Pycnoporus sanguineus
Electrical Phenotypes of Calcium Transport Mutant Strains of a Filamentous Fungus, Neurospora crassa
Osmotic adjustment and requirement for sodium in marine protist thraustochytrid
Ion transport and osmotic adjustment in Escherichia coli in response to ionic and non-ionic osmotica
Turgor regulation in the osmosensitive cut mutant of Neurospora crassa
三、常测哪些指标
Cd2+、Cu2+、Pb2+、NH4+、O2、H+、 K+、 Na+、Ca2+
四、检测这些离子流、分子流,有什么生物学意义
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2)科研案例
以硅藻为材料,研究硅的有效性对硅藻金属敏感性的影响。发现硅饥饿严重影响了对镉、铜和铅的耐受性。多个证据表明富硅细胞比缺硅细胞具有更高的金属吸附和内流速率。富硅细胞通过提高细胞膜和液泡金属转运体的表达和抗氧化活性,清除金属应激产生的活性氧,从而对金属毒性做出响应。
Zhou B, Ma J, Chen F, et al. Mechanisms underlying silicon-dependent metal tolerance in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum. Environ Pollut. 2020;262:114331.
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2)科研案例
研究了城市污水中新出现的污染物CTAC对小球藻F1068细胞(人工去除EPS-R)和自然包覆EPS(EPS-C)对NH4+转运和吸收的影响。结果表明,去除EPS可促进NH4+的转移和吸收,但EPS的存在使NH4+保持不变,并有效地减弱了CTAC(b0.5mg/L)对NH4+吸收的能力,为藻类EPS在未来基于藻类的污水处理应用中在共存的有毒物质的转移和吸收养分中的作用提供了见解。
Li F, Kuang Y, Liu N, Ge F. Extracellular polymeric substrates of Chlorella vulgaris F1068 weaken stress of cetyltrimethyl ammonium chloride on ammonium uptake. Sci Total Environ. 2019;661:678-684.
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1)O2生理功能概述
2)科研案例
以小球藻为材料,研究了其对微培养(5种不同的微孔深度,四种直径水平)的细胞反应。结果表明,O2的流速随着深度从10µm增加到100µm逐渐升高,但随着深度加深到200µm,氧气流速迅速降低,这实际上是细胞生理学和密度的综合结果。综上所述,直径/深度比约为1的微孔中的细胞具有最高的比生长率和氧流量。模拟还表明,在直径与深度比较高的微孔中,传质效果更好。
Zhang P, Xiao Y, Li Z, Guo J, Lu L. Microalgae in Microwell Arrays Exhibit Differences with Those in Flasks: Evidence from Growth Rate, Cellular Carotenoid, and Oxygen Production. Front Plant Sci. 2018;8:2251. Published 2018 Jan 10. doi:10.3389/fpls.2017.02251
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1) Ca2+生理功能概述
2)科研案例
利用NMT技术测定盐胁迫下,卷边桩菇的两种菌株MAJ和NAU的Na+、K+、Ca2+和H+的动态变化。在短期盐处理和长期盐处理下,两种菌株Na+外流明显增加,尤以NAU菌丝更加加明显。卷边桩菇菌丝的抑制剂的敏感性研究显示,两种菌株Na+外排源于Na+/ H+逆向转运。在瞬时盐处理下,两种菌株都有很强的减少K+外流的能力。在非盐胁迫下,两种菌株显示稳定的Ca2+内流。因此推断,在盐胁迫下,卷边桩菇真菌所富含的Ca2+有助于宿根共生体通过增强Na+外排和减缓K+流失来协助宿主植物保持离子平衡的。
Li J, Bao S, Zhang Y, et al. Paxillus involutus strains MAJ and NAU mediate K(+)/Na(+) homeostasis in ectomycorrhizal Populus x canescens under sodium chloride stress. Plant Physiol. 2012;159(4):1771-1786. doi:10.1104/pp.112.195370
五、可以检测哪些样品
1、动物样品
1)细胞
神经细胞、肿瘤细胞、巨噬细胞、淋巴细胞等
2)组织器官
肿瘤、皮肤、胃黏膜、胰岛、脑(海马体等)、胚胎(大鼠、鱼)、斑马鱼皮肤/鳃、耳蜗、心脏(香螺)、卵(鱼、鸡蛋、爪蟾)、骨骼、角膜、脊椎(豚鼠)、肌肉组织(肌纤维、心肌)
3)其它动物样品
珊瑚、螨虫、昆虫(果蝇幼虫的肠、蟑螂血脑屏障、按蚊、长红锥蝽)、蝌蚪、水蛭、蓝蟹(微感毛)、变形虫、水丝蚓
2、植物样品
1)营养器官
茎:边材、心材、微管形成层、木质部
2)生殖器官
花:花瓣、花瓣表皮细胞、花粉
种子:整体、胚
果实:果壳、果皮、果肉(苹果、柑橘)、籽粒、棉花纤维、棉桃
3)细胞:植物悬浮细胞、液泡
4)愈伤组织
3、微生物样品
酵母细胞、菌丝、菌落、微藻、细菌(大肠杆菌)
4、其它生物样品
周丛生物
5、非生物样品
金属、混凝土、泥沙、纳米材料、生物医药材料
六、样品需要做哪些前处理
国际领先的非损伤微测技术最大的特点就是活体、无损检测,因此动植物材料在检测前,不需要任何的液氮速冻、染色、研磨处理等。
1、动物单细胞
因NMT是活体检测,故从培养箱中拿出来后,置于培养皿中,直接检测即可。
2、动物组织
因NMT是活体检测,无需提前处理。如检测部位天然暴露在外,如斑马鱼皮肤离子细胞、侧线毛细胞,直接检测即可。如检测部位位于体内,需在检测时暴露出检测部位(可采用麻醉的方式),后检测即可。
3、植物根茎叶等组织器官
天然暴露在外的组织器官,例如根、茎、叶的表面,无需任何处理,直接检测即可。水培、土培、砂培、平板培养均可。
4、植物原生质体/液泡
因NMT是基于微传感器/探针的非损伤检测,检测时不接触样品,故原生质体、液泡需要从组织或者细胞中,提取出来后检测。
5、植物叶片的表皮细胞、叶肉细胞、盐腺细胞、保卫细胞
无需提前处理。因这些细胞处于组织内部,故检测时采用撕取等方式,暴露出相应细胞即可。
6、植物花粉管
离体萌发:在培养皿中萌发一段时间后即可直接检测;在体萌发:将柱头置于培养皿中,待萌发一段时间后即可直接检测。
7、植物果实
无需提前处理。如待测部位位于果实内部,需在检测前暴露出相应部位即可。
8、植物悬浮细胞
无需提前处理。检测时,置于培养皿中检测即可。
七、有哪些检测方式?
即瞬时处理,是指在检测过程中,在正常测试液中瞬间加入所需的干旱胁迫溶液(PEG或甘露醇等溶液)的处理方法,目的是为了观察瞬间干旱胁迫下,样品短时间内的离子/分子的变化趋势,即短时效应。
2、预处理/提前处理好后检测
是指在干旱胁迫一段较长的时间后(数十分钟/数小时/数天),观察植物离子/分子进出的情况,即长时效应。
八、检测环境是空气还是溶液
检测时,只要求待测部位浸于溶液中(无需整体都浸在溶液里)。
九、样品是如何检测的
十、可以送样检测吗
可以送样检测。目前非损伤微测技术测试服务由中关村NMT产业联盟统筹管理,由遍布全国的25家NMT创新平台服务中心,提供检测服务。点击获取测试服务